A secção de hóquei subaquático iniciou no clube em 2017 e conta, atualmente, com 25 atletas distribuídos pelos escalões de sub-20, sub-24, Elite e Masters (equivalente aos veteranos).
O Estoril Praia foi coroado vice-campeão nacional em 2019 e, posteriormente, a competição em Portugal cessou.
Relativamente a competições internacionais de clubes (liga internacional em que todos os clubes da Europa podem participar), importa destacar o terceiro lugar em 2019 e 2022 no Torneio Internacional de Breda e, ainda em 2022, o terceiro lugar no Campeonato Nacional da África do Sul. Mais recentemente, em 2024, de destacar o sétimo posto no Circuito Moresport International e o 3º Lugar no Torneio Internacional de Le Puy. Já em 2025 a equipa regista um 7º lugar no Circuito Mores Port. Em agosto, 12 atletas do clube representarão a Seleção Nacional no Europeu da Modalidade.

A secção é patrocinada pela AUTOZITANIA – BRAGALIS, a quem agradecemos.